Транспортная компания СПЕЦГРУЗАВТОТРАНС имеет давнюю историю. Предприятие было основано в 1953 году в городе Каменск-Шахтинский, первоначально носило название Каменская автобаза и выполняло автомобильные перевозки, участвуя в строительстве шахт, зданий, сооружений, коммуникаций и прилегающих поселков и городов. По решению Ростовплащадкострой предприятие перешло в подчинение Ростовавтострой и переместилось в поселок Шолоховский.

08.02.1961 г. Каменская автобаза была переименована в Шолоховское автохозяйство №23 на основании Распоряжения Совнархоза от 12.08.1959 года. Продолжая перевозку грузов для строительства промышленных предприятий юга РСФСР в Ростове на Дону, Азове, Каменске-Шахтинском, Белой Калитве, наиболее известные из которых завод «Россельмаш», комбинат «Россия», БКМЗ. Далее предприятие передается в ведение Главного управления Главсевкавстроя Министерства строительства предприятий тяжелой индустрии СССР, объединявшего строительные, автотранспортные и иные тресты.

20.11.1972 года Шолоховское автохозяйство №23 переименовано в Автобазу №23 Ростовского производственного автотранспортного треста на основании приказа Главсевкавстроя №170 от 12.04.1972 года.

В 1973 году предприятие возглавил Афонькин В. Я., начавший работу главным инженером в начале 70-х годов. Василий Яковлевич руководил предприятием до 2007 года. Он сумел сохранить предприятие в сложные 90-е годы и обеспечить стабильное развитие в новом тысячелетии.

Резкое развитие предприятия пришлось на 80-е годы прошлого века. В 1981 году автобаза взяла на себя обязательства перевезти 3605 тысяч тонн грузов и получило в результате 197 тысяч рублей балансовой прибыли. Администрация Автобазы организует показ победителей в соревновании на лучшую колонну, бригаду, участок, лучшего по профессии. Предприятием закладываются расходы на изобретения, рацпредложения и их внедрение на предприятии. В целях повышения коэффициента выпуска автотранспортных средств на линию, повышения производительности труда, увеличения прибыли, вводится дополнительное поощрение сотрудников из фонда материального поощрения.

В 1984 году в связи с постановлением коллегии Главсевкавстроя и президиума Ростовского обкома профсоюза рабочих строительства и промстройматериаловот 17 июля 1984 г «О мерах усиления организационной работы по обеспечению безопасности движения на транспортных средствах», на предприятии стали проводить конкурсы “За безопасность движения”.

Объем перевозок в 1986 году по сравнению с 1985 годом возрос на 9,4% и составил 2047 тысяч тонн и получено доходов на сумму 190,2 тысяч рублей. План по перевозкам строительных грузов, строительным организациям Стройтреста№2 и организациям Главсевкавстроя автобаза выполнила на 116%. Перечень организаций, с которыми работает Автобаза №23: CУ-16, СУ-35, КСМ-5, УПТК, Отделстрой, СОМУ-5 и другие. Из общего объема перевезенных грузов на автомобильном транспорте 91,7% составляют централизованные перевозки.

Автобаза № 23 приняла участие в Социалистических соревнованиях направленных на безусловное выполнение заданий пятилетки. В них участвовало 236 человек, что составляло 91,8% от общего числа работников на предприятии. Соревнования проводились по итогам работы за квартал, полугодие, 9 месяцев, год. Со взятыми обязательствами коллектив справился. Годовой план был выполнен на 102%. Перевезено сверх плана 36,4 тысячи тонны строительных грузов.

В 1988 году на предприятии подписан коллективный договор. Автобаза, автоколонны №1 и №2, бригады, ремонтная мастерская, индивидуально соревнуются, вступая в социалистические соревнования. По состоянию на 1 января 1988 года на балансе автобазы 141 автотранспортное средство, в том числе 117 грузовых. Автомобили до 3-х лет составляют 35,1%, автомобилей от 3-х до 8 лет включительно составляют 48,7% от общего количества.

За 1989 год процент выполнения плана перевозок составил 117,8%. В автопредприятии была проведена работа в направлении внедрения новых методов грузоперевозок. Перевозка грузов ведется по недельносуточному графику, расчеты проводились по планово-расчетным ценам.

02.11.1990 года Автобаза №23 переименована в Арендное автопредприятие №6 хозяйственной ассоциации РОСТОВСТРОЙ, Концерна РОСЮГСТРОЙ на основании приказа №207 от 02.11.1990 г

02.08.1993 года в Арендное автопредприятие №6 переименовано в АООТ СПЕЦГРУЗАВТОТРАНС на основании приказа № 1392 от 02.08.1993 года.В период передачи государственной собственности коллектив стал акционером предприятия.

В 1998 году предприятие впервые осуществило международные перевозки грузов.

В связи с изменением гражданского законодательства РФ 09.09.1999 года АООТ «СПЕЦГРУЗАВТОТРАНС» переименовано в ОАО «СПЕЦГРУЗАВТОТРАНС».

02.11.1990 года Автобаза №23 переименована в Арендное автопредприятие №6 хозяйственной ассоциации РОСТОВСТРОЙ, Концерна РОСЮГСТРОЙ на основании приказа №207 от 02.11.1990 г

С 2003 года предприятие начало вести деятельность по таможенному оформлению товаров.

В 2008 году на основании решения общего собрания акционеров активы предприятия переданы ООО СПЕЦГРУЗАВТОТРАНС. В этом же году предприятие отмечает свое 55-летие.

В 2009 году, следуя Концепции таможенного оформления и таможенного контроля товаров в местах, приближенных к государственной границе Российской Федерации, ООО СПЕЦГРУЗАВТОТРАНС реализовывает мероприятия по переводу деятельности в приграничные таможни.

С 2010 года ООО СПЕЦГРУЗАВТОТРАНС оказывает логистические услуги в основных пунктах перевалки грузов на территории России расположенных по маршрутам международных транспортных коридоров.

С 2011 года вся деятельность по таможенному оформлению производится в формеэлектронного декларирования.

В 2012 году ООО СПЕЦГРУЗАВТОТРАНС начало таможенное оформлениев центрах электронного декларирования по схеме «удаленный выпуск».

ООО СПЕЦГРУЗАВТОТРАНС вошло в ТОП-50 рейтинга таможенных представителей РФ по количеству оформленных деклараций в 2016 году.

Начато оформление товаров международной электронной торговли.

ООО СПЕЦГРУЗАВТОТРАНС включено в реестр таможенных перевозчиков

С 2022 года клиентам предоставляются услуги склада временного хранения в международном аэропорту города Казань